El análisis de semen es el principal recurso a la hora de evaluar la fertilidad de un varón y es de gran ayuda al establecer si un problema del semen, en la cantidad y/o calidad de los espermatozoides, puede ser la causa de infertilidad en una pareja. Se ha de tener en cuenta que en alrededor de la mitad de las parejas que no consiguen concebir hijos hay un problema de infertilidad masculina.

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Tras la práctica de una vasectomía el análisis permite constatar que no hay espermatozoides en el semen y, por tanto, que el procedimiento se ha realizado con éxito. Se utiliza también para diagnosticar el síndrome de Klinefelter, una de cuyas características es la falta de espermatozoides.

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Es también muy habitual la solicitud de un cultivo de semen, esta prueba nos permite analizar la presencia de infecciones causadas por bacterias, hongos u otros micro organismos.

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En la mayoría de los casos, esta prueba se solicita en pacientes con síntomas de prostatitis u orquitis.